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種蕃茄是最令人滿足的一種經驗，因為小小的植物很快就有成績，紅紅的果實讓人開心，而且剛由植株上摘下的果實的香甜，不是買回來的可以相比。
但是蕃茄經常會感染到病菌，如果能事先防患，就可以萬無一失。
所以有經驗的園藝家或農人，身邊會有一些寶貝，足以做好萬全的預防工作。其中一寶就是硫酸銅Copper Sulfate。當硫酸銅與水混合後，就會釋放出一種消毒劑，在初種蕃茄時就使用這種噴劑，可以預防在季節後期出現疾病。
商店中很多含銅的藥劑copper fungicide，不過品牌名稱可能不同，有些叫Copper Spray，或是Copper Dust。買時看說明中的成份，其中含的MCE (metallic copper equivalent) 越多越有效。最好在蕃茄幼時就噴撒，(即種植幼株後的二至四個星期內)，以免發病。通常一次，最多兩次(中間間隔七至十日)就足以達到作用。因為蕃茄很易得霉病 blight，這種黴菌分兩種 early blight 及 late blight，所以之後可以每兩周噴一次，確保無病。
肥料：
蕃茄很需肥，特別是鈣。如果缺鈣嚴重，果實很難成形，而且即使成形，也會中途由基部變黑腐爛。有人將西人治胃痛的藥Tums種入蕃茄旁邊的土中。因為Tums含有很高的鈣成份，甚至當鈣片吃。而且Tums很易溶於水。還有一個朋友將雞蛋殼、蝦殼晒乾後磨碎，最好弄成粉狀，埋入土中。另外很多人會使用石灰補充。園藝店出售包裝好的Garden Lime(或叫Agricultural Lime，即石灰石做的粉)做為補充肥料，這個對於蕃茄，茄子，辣椒等植物很有利。但用時份量要遵指示，否則會將土壤鹼性提得太高。
也可以將阿斯匹靈融入水中之後澆灑，因為阿斯匹靈中的水楊酸會加強植物的抵抗力，這對巔茄科的植物(番茄，辣椒，馬鈴薯等特別有效)。這也是近年來科學研究證實的作用。原來植物本身會自己製造水楊酸，所以澆灑水楊酸只不過是幫助植物對抗各種黴菌及疫症。通常大約500mg的阿斯匹靈，融入一加侖的清水中，(大約四公升)，一星期澆兩次。
也有人不時將香蕉皮種入蕃茄、玫瑰植株旁邊，因香蕉含有較高鉀成份。都是植物需要的。
有關蕃茄最多人問的問題是，雖然開了很多花，為什麼不見蕃茄？除了上面說的缺鈣，一個可能原因是沒有蜜蜂授粉。如果是這樣，你必須人工授粉。方式是買便宜的水彩筆，或細小的刷子，在每朵花之間輕輕的抹，這樣就將雄株及雌株的花粉交配了，才會有果實。(刷子要乾淨，不要重覆使用。)
平時多種些吸引蜜蜂的花草也有幫助。
不過如果你認為花太多，將來果實太多，養料不夠分配，也可以摘去小部份花朵，控制果實數量，同時果實更大，更甜。瓜類也可以用同一方法控制。
為保土壤潮濕，可以多用mulch，就是舖一層覆土在土面，買mulch也可以，或是自己找松針，樹皮屑等來舖。又或是用一般堆肥土。舖覆土最好是在澆水之後舖。
種蕃茄一定要定時澆水，如果根部缺水，花朵有可能萎縮掉落。如果在結果之後缺水，果實會無味(缺糖份)，嚴重的甚至果實掉落。
還有人問，蕃茄的果實掉落，或是花掉落，是什麼原因。你可以在下面找原因：
溫度驟升或驟降(日夜溫差太大)；濕度不夠或是濕度太高；太多氮肥(或是不夠氮肥)；沒有蜜蜂授粉；缺水；病蟲害；太多果實。
此外種蕃茄的土壤有時會自己生病菌，所以如果某一年你的蕃茄突然停止生果實，有可能明年都不會再生，就要停止種蕃茄，甚至不能種同一家族的植物，包括馬鈴薯，茄子等。同時避免在同一個地方每年都種同一類植物。
Tomato Blight 蕃茄的枯萎病(早/晚疫病)
而蕃茄最長見的病癥就是早疫病或遲疫病，tomato early blight，late blight，突然間葉子出現枯黃的斑點，像生了銹，然後枯萎。而且無藥可救。其實這病在馬鈴薯較常見，一發生就大片蔓延，給馬鈴薯農人造成難以彌補的損失。而蕃茄與馬鈴薯是一家，所以免不了也會發生。雖然在蕃茄作物上的傷害就沒那麼大，然而一般人家後院充其量不過種十株八株的蕃茄，一旦發生也令人心疼。
早/晚疫病正式名稱是(Phytophthora infestens)，一旦發生，必須盡快將全株銷毀，(燒毀，或是裝在密封塑膠袋中拋棄)，而且不要放在堆肥箱，否則會蔓延及傳染。
因此預防措施非常重要：
購買蕃茄幼株時仔細檢查葉子，購買葉子健康的植株。同時購買Wilt Resistant(抗萎) 的品種，例如說在品種名稱後面有抗病代號字母：F. V.及N.字樣的品種；
選購成熟期不同的品種，越早熟的品種，越易得早疫病：
輪耕：不要每年在同一地點種同類植物。例如不要在同一地點種蕃茄，馬鈴薯，茄子等植物；也不要將同類植物種在一起；
植株間有足夠空間，使空氣流通；將蕃茄旁枝上的sucker剪去，也能增加空氣流通；(下面有圖)
將底部的枝葉剪去，以免樹葉觸碰地面，接觸地面的病菌、霉菌；(剪時剪刀要消毒，剪時不要傷到莖。)
澆水時將水澆到地面，而非枝葉上。同時在早上澆水，以免夜晚時葉子仍有水份。葉子長期有水是生疫病的原因；
另外有人用阿斯匹靈預防番茄葉子生病。可以在番茄剛生出葉子時噴灑在葉子上，大約一加侖的水放一粒阿斯匹靈(溶解)，每2-3星期一次。這方式對於辣椒，茄子也都有效。
用支架將枝莖撐起，增加空氣流通，減少枝葉觸碰；
蕃茄收成後要收拾乾淨，不要有剩餘的葉子留在地面；
碰過生病葉子的手要用肥皂水清洗過，以免傳染其他植株：
平時多檢查葉子，枝莖；見到有輕微染病的葉子立即剪除，同時噴撒噴劑。一般防blight的噴劑通常都有效。治療早/晚疫病藥劑含有銅copper，或是硫sulfur (sulphur) 上面有圖片，噴撒必須在陰天，或早上使用。避免在炎夏的中午使用，以免進一步灼傷葉子。
其他有效的蕃茄噴撒劑：
預防一般蕃茄枯萎病，亦可以用含有蘇打粉的噴劑Baking Soda spray，這種噴劑自己可以做，在初期時也有效。方式是：
一加侖清水
一湯匙蘇打粉
一湯匙蔬菜油
一湯匙洗碗液dishwashing liquid
為什麼番茄由頂端開始變黃及腐爛？
番茄很容易得一種底部黑爛的病，叫做blossom-end rot，通常是連接花朵的那一頭(而非連接莖的那一頭)開始腐壞，就是原來開花的部位黑爛了，這黑爛的部位會越來越大，通常說這毛病是缺鈣造成，所以大家都知道番茄需要鈣。但有時候你補充鈣都沒有用，原因是當番茄生長環境不好時，就無法吸收鈣質，這表示如果長期缺水，或是水太多(連日大雨，排水又不好)，或是氣候驟變，或是早期施了太多氮肥，都會影響植株吸收鈣質。甚至當植株生長太快，長了太多番茄時，都影響吸收鈣。所以補充鈣都未必有用。
所以除了將種植條件改進到最好，例如適當的澆水，適當的施肥，選擇較低氮肥的肥料，種植時增加土壤排水性，保持土壤乾淨等，以減少得病機會。
除了施適量的calcium nitrate，很多農人會先在土中加石灰Lime，石膏Gypsum，就是為了提高土壤中的鈣。此外也可以增加土壤鈣的成分。此外手中如果有Epsom salt 都是很好的，也很便宜的鈣的來源。
同樣的問題也經常發生在辣椒，黃瓜，意大利青瓜Zucchini等植物上。
下面是用檢查葉子以證明這植株缺乏哪一種養料：葉子變黃，但是有綠色的葉脈，表示缺鐵iron；如果葉子變黃色，有綠色葉脈，但黃色部位出現深色斑點，就是缺乏鋅zinc；如果深色部位是平均的變成褐色(一片)，就是缺鉀 potassium；如果葉子顏色變淡，而葉子尖端開始枯萎，就是缺鎂Magnesium；如果植株停止生長，或是生長遲緩，有可能缺氮肥nitrogen。(這些只是指引，有時不能一概而論，要斟酌其他生長環境。)
其他病癥：
除了早晚疫病，蕃茄有時也會得白粉病，葉子生出一層白粉，逐漸枯萎夭折。又或是銹病，黑斑病，炭疽病等，都可以使用Copper Spray。噴時盡量噴在葉子上，避免噴到莖及枝頂的幼芽。(參看：白粉病怎麼治)
即使你在蕃茄生果實後使用過銅劑，也可以放心食用果實，只要食前仔細洗過。因為各種銅劑都經過衛生部門的測試，證明安全。不過噴撒時要小心，不要使之進入眼睛。最好穿長袖衣服，以免沾到皮膚上。和其他藥劑一樣，最好在清涼的陰天噴撒，避免雨天或是有風及炎熱的正午。如果氣溫到了32度(華氏90度)以上時，就不要使用，否則燒傷葉子。
蚜蟲：
蕃茄也會生蚜蟲，這種非常小的青綠色的小蟲，也有時是白色。經常是吃嫩芽，在玫瑰上常見，如果見到有蚜蟲，可以自製噴劑，用肥皂水 liquid soap，再加一匙蔬菜油Canola oil，就非常有效。這些成份可以驅逐蚜蟲，而菜油就會使蚜蟲窒息。如果沒有肥皂水，就用洗碗精dishwasher，但肥皂水比較有效。(成份：一公升清水，一匙油，幾滴肥皂水。)
所有噴劑在使用後一天如果下雨，就要再補充。
蕃茄的枝出條suckers：
蕃茄也有suckers，但不是由根部生出，而是在主莖與副枝之間生出(見圖)，)如果不及時摘去，還會生出葉子。這些suckers沒有好處，還會搶去養份，所以最好是即時都摘去。而另一張相則顯示，已將sucker剪斷。
有關其他種植蕃茄訣竅：
蕃茄非常喜歡熱，及充份陽光，越多越好。絕對不要使之見霜。有人在種蕃茄(移殖)之前，先在土上舖黑色塑膠布，使土地吸收充份陽光。古時也有人用溫水澆灌，雖然不至於此，但避免用冷水澆也是好的。如果你住的地方長期偏冷，最好選一些較耐寒的品種(hardy tomatoes或是cold-tolerant)。
為了使蕃茄都能照到太陽，有老農人建議，在蕃茄果實結成後，將蕃茄的葉子都摘去，以免遮擋陽光。這是有道理的，因為葉子的光合作用在果實結成後已經不再需要。此外，蕃茄是一年生植物，不需要葉子繼續製造養份。這樣做，蕃茄將可以吸收最多光照，一定越生越大，及很快變紅。
此外，蕃茄幼時(約三尺高時)就可以將底部一尺部位的葉子都摘去，這些葉子沒什麼用，而且容易生病菌。
最後，極大多數植物都不能深種，就是不能種得太深。只有蕃茄可以深種，就是將部份的莖都埋起。因為蕃茄是少有的可以在莖部都生根的植物。而種得深，根部多，也就更健康，可以吸收更多養份。
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